奥本海默不知道的事情太多了。正如他后来回忆的，“我们一点都不知道日本的军事形势。我们不知道以其他的方式是否能使他们接受投降，或者占领日本是否真的是不可避免。在我们的头脑深处认为，占领是无法避免的，因为我们就是那样被告知的”。在其他事情上，他不知道华盛顿的军事情报部门截获并解密了来自日本的电报，它表明日本政府明白战争已经失败并寻求可以接受的投降条件。 例如在5月28日，约翰·J。麦克洛伊增劝说史汀生在建议美国对日本的要求中放弃“无条件投降”的条款。据他们对所截获的日本电报（代号为“魔法”）的解读，麦克洛伊和许多其他高级官员都认识到，东京政的核心成员正试图在接受大部分华盛顿物议的条件下寻求一种方式结束这场战争。艾伦·杜勒斯是当时在瑞士的一名情报人员，他向麦克洛伊汇报：“日本人想要保持他们的天皇和宪法，他们害怕认定军事投降就意味着所有秩序和准则的崩溃。”